خاشقجی ابتدا در حالی که فریاد میزد از دفتر سرکنسول به اتاق دیگری کشیده شد و در آن اتاق بر روی میز مطالعه گذاشته شد. پس از تزریق یک ماده ناشناس، فریادهای خاشقجی خاموش شد. در حالی که خاشقجی هنوز زنده بود، پزشک کالبدشکافی قطعه قطعه کردن بدن روزنامهنگار را آغاز کرد.