همچنین تاجیکستان مانند عربستان، اخوان المسلمین را یک گروه غیرقانونی اعلام کرد. بزرگترین مرکز فرهنگی اخوان المسلمین در شهر خجند نیز مسدود شد. دقیقا در همین شهر، تاجیکستان، یک مرکز فرهنگی و تجاری ایرانی را تعطیل کرد و سپس وقتی ایران خواستار عضویت در سازمان همکاری شانگهای شد، مانع عضویت ایران شد. امری که موجب شد برخی ناظران، به نفوذ بیشتر عربستان در تاجیکستان توجه کنند.