امیرحسین ثابتی، نماینده تهران در مجلس و مشاور سعید جلیلی، ضمن تأیید «بروز اختلاف بین علی باقری، معاون سعید جلیلی، و شخص جلیلی بر سر برجام» گفت: «علی باقری شخصاً آدم محترمی است و هیچ وقت چیز بدی از شخصشان ندیدم. در ماجرای برجام نظر علی باقری خیلی عوض شد. علی باقری با جلیلی اختلاف بر سر برجام پیدا کرده‌اند. یکبار باید سه چهار ساعت با باقری به خاطر عوض شدن نظرش بر سر برجام گفت‌و‌گو کنم. جنس علی باقری را جنس ظریف و روحانی نمی‌دانم.» ویدئویی از صحبت‌های او در این زمینه را در ادامه مشاهده می‌کنید.