در بخشی ازخاطرات آیت الله هاشمی رفسنجانی که شرق منتشر کرده در تاریخ ۵ آذر سال ۷۹ آمده است:
آقای [داود]عبادیانی، [معاون سابق سازمان امور اداری و استخدامی]از گزینش آمد و گفت، بعد از ادغام سازمان برنامه [و بودجه]و [سازمان]امور [اداری و]استخدامی، هر دو سازمان دچار مشکل شده‌اند و امور استخدامی، عملاً به صورت معاونت سازمان برنامه درآمده و سردرگمی حاکم است. آقای [محمد]باقریان که طراح این ادغام بوده، اکنون پشیمان است و حاضر نیست که در این محدوده کار بکند و ناراضی است؛ گویا منتظر بوده که به خودش بسپارند. خواست که در مجمع [تشخیص‌مصلحت‌نظام]کار کند.
دکتر [مهدی]اکبرزاده، مسئول تحقیقات سموم کشاورزی آمد و خواست که به وزارت نیرو و سازمان برنامه [و بودجه]، بگویم که مشکلاتش را رفع کنند. نگران بود، از سرنوشت این مؤسسه پس از ادغام جهاد کشاورزی و آمدن وزیری غیر از دکتر [عیسی]کلانتری، [وزیرکشاورزی]که از او حمایت نمی‌کنند. گفت، ملاقاتی با آقای [سیدمحمد]خاتمی، [رئیس‌جمهور]، داشته، ایشان توجهی به اهمیت کار نکرده است. از خطبه‌های دیروز تمجید کرد.
عصر آقایان [ابوالفضل]توکلی‌بینا و [محمدرضا]اعتمادیان، مشاوران رئیس‌جمهور [در امور اصناف و بازرگانی]آمدند و از ادامه این وضع کشور، در صورت انتخاب مجدد آقای خاتمی، اظهارنگرانی‌کردند. فکر می‌کنند اگر چهار سال دیگر به همین منوال بگذرد، چیزی برای انقلاب و اسلام نمی‌ماند. آقای اعتمادیان از من گله کرد؛ به خاطرگفتن تسلیت به آقای عبدالله نوری، در فوت مادرش، به‌خاطر اینکه محکوم نظام است. گفتم، حساب امور انسانی و عاطفی را باید از حساب امور سیاسی جدا کرد. از خطبه‌های نمازجمعه دیروز ستایش‌کردند.
در گزارش‌های محرمانه آمده که آیت‌الله [حسین]وحیدخراسانی، [از مراجع تقلید]، در جلسات خود، صریحاً از کار دولت آقای [سیدمحمد]خاتمی انتقاد می‌کنند؛ به خاطر تضعیف امور دینی و اخلاقی و عدم توجه به مسائل و مشکلات زندگی مردم و امنیت کشور و نیز عدم انجام قول‌ها و وعده‌هایی‌که به مردم دادند و یا در ملاقات‌های خصوصی به علما می‌گویند و به خصوص از تقویت اهل‌سُنت و تضعیف شیعه در مناطق سُنی‌نشین کشور.