در سال 65 و در آستانه عملیات حساس کربلای چهار و پنج (که به عملیات سرنوشت معروف است) کشف باندی زیرزمینی از نظامیان که به تحریک ارتشیان علیه سپاه می‌پرداختند، از وقایع مهمی است که هاشمی رفسنجانی در کتاب خاطرات سال 65 خود درباره آن توضیح می‌دهد.
هاشمی ذیل خاطرات 30 خرداد ماه می‌نویسد: «احمد آقا آمد. راجع به جنگ و اعلامیه‌هایی که اخیرا در حمایت ارتش و علیه سپاه منتشر می‌شوند، مذاکره شد.» با دنباله‌دار شدن توزیع این اعلامیه‌ها وزارت اطلاعات وارد صحنه شد و با پیگیری‌های انجام شده، دست داشتن یکی از نمایندگان مجلس در تهیه این اعلامیه‌ها فاش می‌شود.
هاشمی در این باره می‌نویسد: «آقای ری‌شهری اطلاع داد که احمد کاشانی نماینده نطنز، به جرم شرکت در گروه زیرزمینی از نظامیان که اعلامیه در جهت تفرقه ارتش و سپاه می‌دادند، دستگیر شده است. هشتمین شماره آن اعلامیه در منزل وی برای پخش آماده بوده. آقای محمدرضا باهنر مراجعه کرد و در این باره توضیح خواست. جریان را گفتم و وعده دادم برای حل مشکل کمک کنم.»
سید احمد مصطفوی کاشانی نماینده مردم نطنز در مجلس شورای اسلامی به همراه چند تن از افسران ارتش به اتهام تحریک ارتشیان علیه سپاه پاسداران بازداشت شد. این عده به حکم دادستانی نیروهای مسلح دستگیر شدند. اتهام کاشانی، تنظیم، تهیه و تکثیر و توزیع اطلاعیه‌هایی بوده است که در آن ارتشیان علیه سپاه پاسداران تحریک می‌شده‌اند. روابط عمومی وزارت اطلاعات در این باره اعلام کرد: «این شب‌نامه‌ها با الهام از ضد‌انقلاب در حساس‌ترین مقطع دفاع مقدس ملت مسلمان ایران منتشر شد تا توجه نیروهای مسلح را در جبهه‌های جنگ به مسایل غیرواقعی بکشاند.»
نشریه گزارش، از انتشارات دفتر تبلیغات حوزه علمیه قم در این زمینه نوشت: «به دنبال مسایلی که حول و حوش تغییر در فرماندهی نیروی زمینی ارتش اتفاق افتاد، نیروهایی از جناح راست با استفاده از اطلاعاتی که از این جریان داشتند، اقدام به برخورد با مسایل جنگ کرده و با امضاهای مجعول اطلاعیه‌ها و شب‌نامه‌هایی صادر کردند. در این رابطه احمد کاشانی نماینده نطنز در مجلس و نیز چند تن از سران ارتش که سابقه فعالیت در انجمن حجتیه را داشته‌اند، از جمله سرهنگ کتیبه ریاست رکن 2 ارتش و سرهنگ آگاه به اتهام شرکت در انتشار مسایل تفرقه‌افکنانه بین ارتش و سپاه توسط وزارت اطلاعات دستگیر شدند.»
این وقایع که در اعتراض به استعفای صیاد شیرازی از پست فرماندهی نیروی زمینی ارتش (در اعتراض به محسن رضایی) روی داد، در رسانه‌های خارحی بازتاب زیادی در پی داشت و موجب سوءاستفاده این رسانه‌ها از این خبر شد.
رادیو بی‌بی‌سی در این زمینه گفت: «سید احمد کاشانی پسر آیت‌الله کاشانی است که مخالفتش با مصالحه کردن با فرانسه در رابطه با بازپرداخت وام یک میلیارد دلاری ایران، به آن کشور به شهرت او افزود. آخرین اعتراض سید احمد کاشانی به دولت در رابطه با بدرفتاری با پزشکان بود. او اعتراض خود را در قالب سوالی خطاب به وزیر کشور مطرح کرد که در اجلاس مجلس صورت گرفت. در پاسخ به سوال احمد کاشانی، وزیر کشور او را متهم کرد که با سناتورهای آمریکایی هم‌صدا شده است. هیچ‌گونه اطلاع رسمی که حاکی از دلایل بازداشت احمد کاشانی باشد در دست نیست.»
رادیو بی‌بی‌سی چند روز بعد به نقل از جهانگیر بهروز سردبیر نشریات اکو در تهران گفت: «این دستگیرشدگان شب‌نامه‌هایی پخش کرده‌اند که ظاهرا قصد آن‌ها این بوده است که در داخل ارتش یک هسته مقاومت در مقابل سپاه به وجود بیاورند. در مرحله کنونی فعالیت آن‌ها منحصر به تشکیل جلسات و پخش این‌گونه شب‌نامه‌ها در واحدهای نظامی بوده است. در آخرین شب‌نامه‌ای که شماره 7 آن است، به نظامیان هشدار داده شده که در مقابل توسعه نفوذ و قدرت سپاه بی‌تفاوت نباشند، زیرا اگر وضع به همین منوال پیش برود سپاه جانشین ارتش خواهد شد.»
هاشمی به تلاش‌های برخی نمایندگان برای آزادی وی اشاره کرده و در این باره می‌نویسد: «مراجعه نمایندگان خط راست برای نجات آقای احمد کاشانی از زندان این روزها زیاد شده است. خود من هم مایلم نجات یابد. ولی کسانی هم مانع می‌شوند.»
شایان ذکر است در چنین شرایطی سران نظام سعی در رفع اختلافات داشتند که هاشمی رفسنجانی به نمونه‌ای اشاره کرده و می‌نویسد: «در جلسه سه‌شنبه نمایندگان شرکت کردم. توضیحاتی درباره جنگ... و بازداشت و احمد کاشانی دادم و نمایندگان را نصیحت کردم که به اختلافات دامن نزنند.»