آیت الله هاشمی رفسنجانی در دیدار با جمعی از اعضا فرهنگ و سیاست دانشگاه شیراز در سال ۱۳۹۱ گفت: اختلافی که من با رهبری داشتم، همان‌هایی است که در نامه‌ای به ایشان نوشتم این دولت را (نهم و دهم) دولت خوبی نمی‌دانستم. بله، ما بر سر این موضوع، اختلاف داریم در انتخابات نهم (ریاست جمهوری)، من دخالت سپاه و بسیج راخیلی بد می‌دانم، حیثیت خودشان را بردند، دو نهاد مقدس خیلی ارزشمند که در جنگ، به حق اعتبار گرفتند، ولی قربانی این جریان شدند و خیلی هم آسیب دیدند. فکر می‌کنم جریان نظامی، امنیتی و تاحدودی قضایی، بیش از حد، دارند در سیاست، اثر می‌گذارند و این مصلحت نیست. ولی خب، اگر رهبری بخواهند. طبعاً غیر از مباحثه خصوصی، کار دیگری نمی‌کنم..