كارگردان سريال مختارنامه درباره سرنوشت پخش صحنه‌هاي مربوط به حضرت ابوالفضل(ع) نيز گفت: كسي هنوز به ما پاسخي نداده و در اين رابطه متاسفانه يك جريان درست كرده‌اند. عاشوار نقطه اوجي دارد كه حضرت ابوالفضل(ع) است. اين بخش‌ها ساخته شده و 12 دقيقه زمان دارد آن هم با همه جزئياتش ولي فعلاً پخش آن مقدور نيست. به دليل تصميم مديران صدا و سيما و با بيانيه‌اي كه يكي از مراجع داد؛ شرايطي پيش آمد كه باب گفت‌وگو و تعامل را بست. من نمي‌دانم چطور مي‌توان آن حرف‌ها را جمع كرد؟!
به گزارش فارس وي ادامه داد: در اين شرايط مشكل را من نمي‌توانم حل كنم من اگر خودم به اين بخش‌ها اعتقاد نداشتم كه آنها را نمي‌ساختم و اينقدر برايشان زحمت نمي‌كشيدم. كل اين بخش‌ها 12 دقيقه زمان دارد كه حدود يك ماه از من وقت گرفت و با سختي و مرارت بسياري همراه بود. بازي با يك دست و مشك در دهان از لحاظ تكنيكي كار بسيار سختي بود. اگر ما مي‌دانستيم كه در آينده پخش اين بخش‌ها با مشكل مواجه مي‌شود اين بخش از عاشورا را به شكل ديگري تصوير مي‌كرديم. در اين باره هنوز به نتيجه‌اي نرسيده‌ايم و فكر نمي‌كنم اين قضيه به نتيجه برسد.
ميرباقري با بيان اينكه تناقض جدي در حوادث مختارنامه و مكتوبات تاريخي وجود ندارد، درباره موسيقي سريال عنوان داشت: موسيقي سريال با نظر من ساخته شد. 6 بار آقاي توسلي را وادار كردم كه تيتراژها را بسازد و بعد از آن به ساختار موسيقي رضايت دادم. من در مجموع از آنچه اتفاق مي‌افتد راضي هستم. تنها جاهايي از موسيقي به دليل اينكه يك هفته بيشتر براي آماده‌سازي وقت نداشتيم تنبل مي‌شد، به همين دليل بهزاد عبدي هم به جمع اضافه شد و اين روزها موسيقي بهتري به لحاظ جزئيات در سريال مي‌شنويم.
همچنين ميرباقري درباره اينكه چرا درباره اسطوره‌هاي ايراني سريال نمي‌سازيد، تاكيد كرد: من ايده‌هاي بسياري براي ساخت شاهنامه در ذهن دارم ولي تا به حال موفق به ساخت آن نشده‌ام.
اين كارگردان درباره نوع كشته‌شدن آدم‌ها و مجازاتشان توسط مختار نيز توضيح داد: نوع كشته‌شدن آدم‌ها در روايت‌ها همين‌طور است ولي اگر نتوانستم آن‌طور دربياورم كه دلتان خنك شود، ايراد از من است.
وي ادامه داد: صحنه نبرد مختار و حرمله يكي از قوي‌ترين صحنه‌هاي مختارنامه است و تكنيك نيست بلكه اجرا شده است. مختار بيشتر يك «ليدر» ديده شده است تا يك «جنگجو».