خاقانی یکی از بازیکنانی بود که توسط علی خطیر در لیست خروجی باشگاه استقلال قرار گرفت تا مدیران باشگاه بتوانند قوانین مربوط به سقف بودجه را رعایت کنند.
وینگر جوان استقلال دقایقی پیش با انتشار متنی در صفحه اینستاگرام خود نوشت: و داستانی که به پایان آمد. یه مربی کاملا حق داره که بازیکناش را خودش انتخاب کنه و من اصلا گلایه ندارم و به سرمربی محترم استقلال کاملا این حق را میدم .. ولی تنها گلایم اینه که شما اگه من را نمیخواستین چرا دقیقه آخر نقل و انتقالات به این نتیجه رسیدین؟ چرا مخالف رفتن من بودین؟ مگر سرمایه باشگاه نبودم؟ بازم از استقلال بزرگ و همه مربیان عزیز که برام زحمت کشیدن تشکر و سپاسگزاری میکنم از هواداران عزیز که سنگ تموم برام گذاشتن ممنونم انشالله روزی با قدرت برمیگردم بازم برای آقا جواد، باشگاه استقلال آرزوی موفقیت میکنم.