بنا به اسناد موجود ساواك، شهيد آيت الله دكتر بهشتي سالها قبل از انقلاب از حضرت آيت‌الله خامنه‌اي به عنوان يكي از علماي موجه ملي و با نفوذ آينده كشور ياد كرده بود.
بنا بر اسناد ساواك، دكتر سيد محمد بهشتي در سال‌هاي پيش از انقلاب ضمن تمجيد از شخصيت حضرت آيت‌الله خامنه‌اي پيش بيني كرده بود كه در آينده ايشان يكي از علماي موجه ملي و با نفوذ كشور خواهند شد.
همچنين در اين اسناد آمده است كه آيت الله سيد محمد بهشتي در مشهد با حضرت آيت‌الله خامنه‌اي رابطه بسيار نزديك داشت و از افكار او بسيار تمجيد و تحسين مي‌كرد.
متن كامل سند به شرح زير است:
1352/5/21
موضوع: دكتر سيد محمد بهشتي
ياد شده ضمن تعريف و تمجيد از خامنه‌اي اظهار اميدواري نموده كه در آينده خامنه‌اي يكي از علماي موجه ملي و با نفوذ كشور خواهد شد. ضمنا نامبرده روز 1352/5/16 با اتومبيل شخصي باتفاق خانواده؛ مشهد را بقصد تهران ترك كرده است.
نظريه شنبه - دكتر سيد محمد بهشتي در مشهد با سيد علي خامنه‌اي رابطه بسيار نزديك داشت و از افكار او بسيار تمجيد و تحسين مي‌كرد.
نظريه يكشنبه - نظر قابل ذكري ندارد.