آژاکس بعد از سال‌های میانی دهه ۱۹۹۰ افت کرده بود تا این که به دهه ۲۰۰۰؛ تیمی که با وسلی اسنایدر، نایجل دی‌یونگ، جانی هیتینگا، رایان بابل، مارتین استکلنبرگ و رافائل فان‌درفارت که کاپیتان تیم شده بود، در فوتبال هلند و اروپا باز هم اسمی برای خودش دست و پا کرد.
اما عجیب‌ترین اتفاق وقتی رخ داد که زلاتان ایبراهیموویچ پسر مغرور سوئدی از مالمو به این تیم پیوست و از همان ابتدا با وجود کیفیت بالا دردسرساز شد.
فان‌درفارت که درگیری‌های عجیبی با زلاتان داشت در این باره می‌گوید: «آن زمان هردو جوان بودیم و از بهترین بازیکن‌های آژاکس. او به باشگاه آمد و اعتقاد داشت بهترین بازیکن آژاکس است. اما مثل حالا رفتار نمی‌کرد و فکر کنم کمی حسود بود. واقعاً مشکل بزرگی با او نداشتم.»
این زوج ۶۸ مرتبه کنار هم بازی کردند و ۲ مرتبه قهرمان اردیویزی هلند هم شدند، اما اتفاق عجیب در بازی دوستانه سوئد و هلند در آگوست ۲۰۰۴ رخ داد؛ دیداری که با تساوی ۲-۲ به پایان رسید و فان‌درفارت تنها ۷ دقیقه بعد از ورود به زمین توسط زلاتان مصدوم شد.
فان‌درفارت صحبت‌های زلاتان به خودش را بعد از آن ماجرا این‌گونه شرح داد: «من از عمد به تو صدمه نزدم و این را می‌دانی... اگر من را متهم کنی، هردو پایت را خواهم شکست و این مرتبه عمدی خواهد بود.»
همین درگیری‌های زلاتان با فان‌درفارت باعث شد با انتقال ۱۶ میلیون یورویی او به یوونتوس موافقت شود و یک سال بعد هم رافائل را به هامبورگ فروختند.