علي افشاري در پي حملات سبزها به اكبر گنجي كه اين جريان ضد انقلابي را تمام شده دانسته بود، رفتار سبزها را با وي استبدادي اعلام كرد.
علي افشاري، در يادداشتي در سايت ضد انقلابي گويا نيوز، حملات پيوسته و گاه اهانت‌آميز به منتقدين موسوم به جنبش سبز را مورد انتقاد قرار داد. افشاري با قيم مآبانه خواندن رفتاربرخي از "سبز "ها، تاكيد كرد آنها توان تحمل نظر مخالف را ندارند.
علي افشاري مي‌نويسد: «قرار نيست در جامعه آزاد همه بگونه اي بنويسند و سخن گويند كه خوشايند همگان باشد و يا در تاييد گفتمان زمانه و يا نگرش غالب در خصوص رويداد هاي سياسي بنويسند. بيان رويكرد هاي متفاوت و يا نظرات نادر و چالش برانگيز و به قول علما شاذ از ضروريات و لوازم آزادي بيان است».
وي در عين حال افزود: «بحث من نيست كه نمي توان با اكبر گنجي مخالفت كرد، بلكه سخن بر سر چگونگي مخالفت است. بر آشفتن ها ،هجمه هاي سنگين و ترور شخصيت ها محل ايراد است. جيغ نامه ها و پرخاش گري هاي كلامي مورد سئوال است كه انگار گويي وي مرتكب بزرگترين خطاي عالم شده است».