در پی درگذشت دکتر عباس شیبانی از پیشکسوتان نهضت اسلامی، حجت الاسلام و المسلمین سید محمد خاتمی پیام تسلیتی را صادر کرد.
متن این پیام بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
جناب دکتر عباس شیبانی، انسان شریف، مومن و پاکباخته که عمر شریف خود را در مبارزه با بیداد و تبعیض و دفاع از حق و حقیقت و حرمت مردم گذراند و همواره برای بهبود زندگی بخصوص برای مستضعفان کوشید دیده از دار فانی فروبست و بدیدار معبود خود شتافت.
من این مصیبت را بهمه دوستان، بستگان و خانواده محترم ایشان بخصوص فرزند گرانقدرشان تسلیت می‌گویم و از خداوند منان برای این فقید سعید آمرزش و رحمت اله و برای بازماندگان معزز صبر و اجر و سلامتی مسألت می‌کنم.