در شرایطی که سازمان لیگ فوتبال و کمیته مسابقات این سازمان روزهای سخت و فشرده‌ای را برای برگزاری لیگ پشت سر می‌گذارند، برنامه‌ریزی جام حذفی نیز انجام شده است.
طبق تصمیم اتخاذ شده، جام حذفی فوتبال باشگاه‌های کشور فصل 1400-1399 از اواخر دی ماه با حضور قهرمان استان‌ها آغاز می‌شود و پس از مشخص شدن چهره تیم‌های برتر، به ترتیب تیم‌های لیگ دسته سوم، دوم، اول و لیگ برتری وارد جدول مسابقات خواهند شد.