در حالی که باری دیگر با ابراز نظر رييس شوراي شهر اصفهان پرونده ورود مترو از چهار باغ عباسی گشوده شد؛رييس سازمان ميراث فرهنگي و گردشگري استان اصفهان اكيدا به مديران مسؤول اخطار کرد و گفت: «با خاطيان به حكم قانون و وظيفه‌ي خود برخوردمی کنیم.»
رييس شوراي شهر اصفهان گفته است كه تونل مترو اصفهان يك مرتبه و با زاويه زياد به سمت شمس‌آبادي نمي‌تواند برود، بنابراين با شيب ملايم به سمت محور چهارباغ حركت خواهد كرد.
سعيد بكتاش به‌عنوان رييس سازمان ميراث فرهنگي و گردشگري استان اصفهان ضمن اذهان براینکه تا اين لحظه عبور مترو از چهارباغ عباسي صورت نگرفته است.گفت: «اگر خبر يادشده به منزله‌ي زمينه‌سازي براي عبور مترو از قسمتي از چهارباغ عباسي باشد، اكيدا به مديران مسؤول اخطار مي‌كنيم، با توجه به توافق‌هاي انجام‌شده عبور مترو از چهارباغ عباسي ممنوع است و با خاطيان به حكم قانون و وظيفه‌ي خود برخورد مي‌كنيم و جلوي تعرض را خواهيم گرفت.»
وي اظهار داشت: «به مديران مسؤول توصيه مي‌كنيم، به مصوبات شوراي عالي ترافيك با توجه به توافق‌هاي انجام‌شده احترام بگذارند و خود را درگير مشكلاتي كه به ضرر مردم و شهر هستند، نكنند.»
بكتاش تاكيد كرد: «طبق مصوبه‌ي شوراي عالي ترافيك و طبق كار كارشناسي صورت‌گرفته و توافق‌هاي بين مديران شهر و ميراث فرهنگي، مترو نبايد از چهارباغ عباسي عبور كند.»
ماجراي عبور مترو از چهارباغ اصفهان، از ابتدا
پس از بحث‌هاي فراوان درباره عبور مترو از چهارباغ يا شمس‌آبادي در سال 1383، مدير وقت روابط عمومي اداره ميراث فرهنگي اصفهان چهارم مردادماه 1383، اعلام كرد: «در سال 1378 مصوب شد كه مترو از خيابان شمس‌آبادي عبور كند، زيرا عبور مترو از خيابان چهارباغ سبب مي‌شد آسيب‌هايي جدي به اين محوطه تاريخي وارد شود.»
پس از اين اعلام نظر، عبدالحسين سيف‌اللهي ـ مديرعامل قطار شهري اصفهان ـ در تيرماه 1383 اعلام كرد: «براساس مصوبه‌اي كه در سال 1379 به تصويب شوراي عالي كشور رسيد، مشخص شد كه مترو اصفهان از زير اين خيابان عبور كند و طبق مصوبه سال 1379، مسير مترو از 14 متري سطح خيابان چهارباغ عباسي مشخص شد.»
در 28 فروردين‌ماه 1385 شوراي ترافيك استان اصفهان در نشستي عبور مترو را از چهارباغ تصويب كرد، تا بار ديگر، كشمكش‌ها بر سر عبور يا عدم عبور مترو از زير چهارباغ عباسي از سرگرفته شود.
بلافاصله پس از اين تصميم در نيمه ارديبهشت‌ماه گزارش شد كه تعدادي درخت در محدوده چهارباغ بالا براي احداث ايستگاه مترو قطع شدند كه در اين‌باره، سيف‌اللهي ـ مجري قطار شهري اصفهان ـ در گفت‌وگويي بيان كرد: «مردم اصفهان بايد تصميم بگيرند كه مترو مي‌خواهند و درخت يا چهارباغ.»
اما حسين‌علي وكيل ـ رئيس وقت سازمان ميراث فرهنگي و گردشگري ـ در واكنش به قطع درختان خيابان چهارباغ بالا كه به گفته بسياري از كارشناسان معماري اين خيابان نيز تاريخي است و كاخ شاه‌عباس به نام كاخ هزارجريب همراه با 22 باغ در اطراف اين خيابان در دوره صفوي ساخته شده‌اند، در 16 ارديبهشت‌ماه سال جاري در نامه‌اي به سيف‌الله امينيان ـ معاونت حفاظت فني سازمان ميراث فرهنگي و گردشگري ـ اعلام كرد كه در محور مياني خيابان چهارباغ در تقاطع خيابان شريعتي تعدادي درخت قطع شده‌اند و نگراني خود را از اين موضوع نشان داد.
البته قطع درختان به چهارباغ هزارجريب ختم نشد و براي آن‌كه مترو در محور شمالي ـ جنوبي شهر اصفهان كه از جنوب به‌سمت خيابان چهارباغ هزارجريب و از شمال به‌سمت خيابان چهارباغ عباسي در حركت بود، به راه خود ادامه دهد، در مسيرش تعدادي از درختان چهارباغ پايين را نيز قرباني كرد و اكنون بنا به گفته معاون پشتيباني قطار شهري اصفهان و شواهدي مانند تخريب كف‌پوش انتهاي خيابان چهارباغ پايين (ابتداي چهارباغ عباسي) تونل مترو به دو متري خيابان چهارباغ عباسي رسيده است.