معاون فرهنگی وزارت علوم ، تحقیقات و فناوری درباره‌ی فعالیت تشكل‌های اسلامی دانشجویان خصوصا انجمن‌های اسلامی دانشجویان گفت: تشكل‌های دانشجویی و از جمله انجمن‌های اسلامی در هر دانشگاه هویت مستقل دارند و بدون اتحادیه‌ها فعالیت خود را ادامه می دهند. به عبارت دیگر اتحادیه از مجموعه تشكل‌ها تشكیل می‌شود اما به تشكل‌ها هویت و جایگاه قانونی نمی‌دهد.
محمدباقر خرمشاد ، با بیان این كه تشكل می‌تواند مدتی عضو اتحادیه‌ای باشد و بعد خارج شود، اما تشكل‌ها نمی‌توانند عضو اتحادیه‌ای غیرقانونی باشند، اظهار كرد: هر تشكل اسلامی براساس قوانین موجود به صورت مستقل در هر دانشگاه متولد شده و فعالیت می‌كند و می‌تواند عضو اتحادیه‌ای باشد یا نباشد.
خرمشاد افزود: بدیهی است اگر اتحادیه‌ای به هر دلیلی فاقد مشروعیت شود تشكل سیاسی متمایل به آن می‌تواند در چارچوب مقررات آیین نامه‌های موجود خصوصا آیین‌نامه تشكل‌های اسلامی در دانشگاه‌ها فعالیت خود را ادامه دهد و درواقع هر رفتار خارج از قانون، قابل رسیدگی در هیات نظارت آن دانشگاه خواهد بود.