مرحوم حسن حبیبی در حرم مطهر امام خمینی(ره) به خاک سپرده شد.
به گزارش ایسنا، پس از برگزاری مراسم تشییع از مقابل بنیاد ایران‌شناسی که با حضور جمعی از شخصیت‌های کشوری انجام شد، سیدحسن خمینی بر پیکر وی نماز خواند و پس از قرائت زیارت عاشورا، پیکر حسن حبیبی را در حرم حضرت امام خمینی (ره) به خاک سپردند.
سیدحسن خمینی، آیت‌الله موسوی بجنوردی، حداد عادل، عبدالله نوری، علی یونسی، مجید انصاری، محمدعلی نجفی، کرباسچی، علیخانی، اسحاق جهانگیری، حسین مرعشی و محمدرضا عارف از شخصیت‌هایی بودند که در مراسم خاکسپاری وی در حرم امام (ره) حضور داشتند.