چندین سویه مختلف از آنفولانزای پرندگان در گردش هستند که همگی دارای ساختارهای پروتئینی اندکی متفاوت از یکدیگر میباشند. رایجترین سویهای که در طول تاریخ دیده شده سویه H ۵ N ۱ است، اما پنج سویه وجود دارند که در سالیان اخیر باعث نگرانی سازمان بهداشت جهانی شدهاند.