تنش میان دولت با شورای نگهبان به شأنیت قضایی بر میگردد که شورای نگهبان طبق تفسیری که از اصل 99 قانون اساسی صورت داده برای خود قایل شده است. این اختلاف تنها میان دولت و شورای نگهبان نیست.بلکه میان جامعه حقوقی و مجلس با شورای نگهبان نیز وجود دارد. اختلافی که از سال 1370 تاکنون با اعمال نظارت استصوابی وجود داشته و هنوز حل نشده است.