وزارت تحقیقات، فناوری و علوم هم جعلی بودن مدارک تحصیلی مهدی هاشمی را تایید کرده و در نامهای خطاب به وزیر راه و شهرسازی اعلام کرده است که؛ طبق بررسیهای به عمل آمده در حوزه معاونت آموزشی وزارت متبوع و همچنین نامه مدیرکل امور آموزشی دانشگاه امام حسین (ع) مدرک تحصیلی دوره کارشناسی نامبرده مورد تایید نیست و بالطبع ادامه تحصیل ایشان در دوره کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی که مهمترین شرط آن داشتن مدرک دوره تحصیلی پایینتر است، محقق نبوده و جای اشکال دارد.