آیت الله صادق گیوی خلخالی تا روز 24 بهمن 1357، حاکم شرع دادگاه های انقلاب شد.
وی در مقام حاکم شرع در سالهای ابتدایی انقلاب زیر حکم اعدام بسیاری از سران نظام شاهنشاهی را امضاء کرد. معروف ترین این افراد امیر عباس هویدا بود.
خلخالی در خرداد ماه سال 1359 به عنوان نماینده مردم قم به مجلس شورای اسلامی راه یافت. در همین سال از مقام حاکم شرعی دادگاه انقلاب استعفا کرد.
در سال 1360 با حفظ سمت های قبلی اش به سرپرستی کميته مبارزه با مواد مخدر منصوب شد.
آیت الله خلخالی در اولین دوره مجلس خبرگان که انتخابات آن در سال 1358 انجام شد، به اين مجلس راه يافت.
در انتخابات دومین دوره مجلس شورای اسلامی رد صلاحیت شد، اما نامه امام خمینی(ره) به شورای نگهبان صلاحیت او را بازگرداند.
تا سال 1367 در مجلس سوم به عنوان نماینده مردم قم حضور داشت.
آيت الله خلخالی سال های پایانی عمرش را با ابتلا به پارکینسون و بیماری قلب و مغز گذراند و در ششم آذر ماه 83 در سن 77 سالگی در گذشت.
وی مجموعه خاطراتش را در دو جلد و با نام های "خاطرات" و "ایام انزوا" منتشر ساخته است. آيت الله خلخالی در سال 1382 رساله عمليه خود را منتشر کرد.
محمد صادق صادقی گیوی معروف به شیخ صادق خلخالی در سال 1305 در روستای گیوی از توابع شهر خلخال در استان اردبیل به دنیا آمد.
تا ششم ابتدایی در اردبیل محصل بود. آنجا به دروس حوزوی علاقه مند شد. در سن هفده سالگی از اردبیل به قم رفت. در حوزه علمیه قم همراه با سید مصطفی خمینی در حلقه درس های امام خمینی(ره) شرکت داشت.